环肽CADD科学家(J20012)

1. 结构分析与建模： 1) 基于靶点三维结构（X-ray、Cryo-EM、AlphaFold模型），执行结合位点识别、可药性评估及结合口袋分析。 2) 运用分子对接（Docking，如Glide、GOLD、AutoDock）及多肽-蛋白对接工具，开展环肽模型搭建。 2. 环肽发现与优化（AIDD）： 1) 基于AI生成式与结构预测模型（RFdiffusion/RFpeptide、ProteinMPNN/LigandMPNN、AlphaFold/Boltz等）进行环肽骨架生成、序列设计与环化策略设计；利用自由能微扰（FEP/TI）、MM-GBSA等算法精确计算结合亲和力，开展环肽SAR分析和改造。 2) 运用GROMACS/Amber进行模型的MD模拟（含增强采样），解析蛋白-配体/蛋白-环肽复合物的相互作用机制、构象系综及构象变化。 3) 综合评估环肽的膜通透性、酶稳定性及ADMET性质…… 完整岗位描述与官方投递入口,请登录后在岗位详情页查看。

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